イベント
[9月10日] 理研シンポジウム:転写産物解析を使って疾患を研究する
[日時]
[時間]
[主催]
理化学研究所 ライフサイエンス技術基盤研究センター 機能性ゲノム解析部門
[概要]
本シンポジウムでは、転写産物を網羅的に解析するCAGE法(Cap Analysis of Gene Expression)を使った疾患研究の最前線についてお伝えします。
CAGE法は、理化学研究所が開発した技術です。転写産物の発現量を、プロモーターごとに、1塩基の解像度で、 ゲノムワイドに定量解析できる特徴があります。その検出感度の高さにより、従来の発現解析におけるノイズなどの問題が解決したのをはじめ、より正確でゲノ ムワイドな発現プロファイルの取得はもちろん、複雑な転写制御ネットワークの解析が可能になりました。これらの手法は生命科学の基礎研究にとどまらず、新しいバイオマーカーの同定、薬物の作用機序の解明、創薬ターゲット探索、ドラッグ・リポジショニングなど医療診断技術や薬理学、広範な医薬探索などへの応用が期待されています。
本シンポジウムの第1部では、CAGE法を使った疾患研究の現状について報告します。ゲノムワイド関連解析(Genome Wide Association Study, GWAS)で同定された表現型関連SNPマーカーとエンハンサーの関連、治療抵抗性小児ぜんそくと遺伝子発現の関係、再生医療の基礎となる細胞のマーカー、歯周病のバイオマーカー、薬物応答プロファイリングやシグナル伝達ネットワークについて最近の話題をご紹介します。
第2部では、これからCAGE法を利用したい研究者のために、CAGEデータの取得方法、利用できるデータベース、新しい解析ツールをご紹介します。
疾患の原因解明、治療方法の研究などに日々取り組んでいらっしゃる医学・薬学の研究者、製薬会社の研究者等多くの方々のご来場をお待ちしています。
[プログラム (今後変更することもありますのでご了承ください)]
◆ イントロダクション | |
13:00 - 13:20 | From Technology to Biology Piero Carninci (Riken Center for Life Science Technologies Division of Genomic Technologies, Director) http://fantom.gsc.riken.jp/ |
◆ 第1部 網羅的転写開始点解析(CAGE法)による疾患研究 | |
13:20 - 13:40 | Transcribed enhancers relevant for human disease Erik Arner (Riken, Center for Life Science Technologies, Center Director's Strategic Program) [関連論文:A promoter-level mammalian expression atlas] |
13:40 - 14:00 | Transcriptome analysis of controlled and therapy-resistant childhood asthma reveals distinct gene expression profiles Andrew T. Kwon (Riken, Center for Life Science Technologies, Center Director's Strategic Program) [関連論文:Transcriptome analysis of controlled and therapy-resistant childhood asthma reveals distinct gene expression profiles] |
14:00 - 14:20 | FANTOM5データベースを活用した新規角膜内皮細胞特異的マーカーの同定 / Discovery of molecular markers to discriminate corneal endothelial cells in the human body 吉原 正仁 (大阪大学大学院医学系研究科脳神経感覚器外科学(眼科学)/ 理化学研究所ライフサイエンス技術基盤研究センター機能性ゲノム解析部門) [関連論文:Discovery of Molecular Markers to Discriminate Corneal Endothelial Cells in the Human Body] |
休憩 15分 | |
14:35 - 14:55 | CAGEを使ってシグナル伝達-転写ネットワークを解剖する / Dissecting signal transduction-transcription network using CAGE technology 岡田眞里子 (理化学研究所 統合生命医科学研究センター 統合細胞システム研究チーム) [関連論文:Promoter-level expression clustering identifies time development of transcriptional regulatory cascades initiated by ErbB receptors in breast cancer cells] |
14:55 - 15:15 | CAGE法を用いた薬物応答プロファイリングの試み / Drug response profiling using CAGE technologies 鈴木治和 (理化学研究所ライフサイエンス技術基盤研究センター機能性ゲノム解析部門) [関連論文:Capturing Drug Responses by Quantitative Promoter Activity Profiling] |
15:15 - 15:35 | CAGE法による歯周炎関連線維芽細胞の新たなバイオマーカーの同定 / Discovery of novel biomarkers of periodontitis-associated fibroblasts by CAGE sequencing 堀江真史 (東京大学 保健・健康推進本部 保健センター / 理化学研究所ライフサイエンス技術基盤研究センター機能性ゲノム解析部門) [関連論文:Paradigm shift in pharmacological treatment of periodontitis] |
休憩 10分 |
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◆ 第2部 CAGE法を研究に使うには | |
15:45 - 16:05 | CAGE法を用いたトランスクリプトーム解析ワークフロー / Transcriptome Analysis Workflow using CAGE 眞鍋理一郎 (理化学研究所ライフサイエンス技術基盤研究センター機能性ゲノム解析部門) [関連論文:RECLU: a pipeline to discover reproducible transcriptional start sites and their alternative regulation using capped analysis of gene expression (CAGE)] |
16:05 - 16:20 | 網羅的転写開始点データベース(FANTOM5ウェブリソース)の利用 / FANTOM5 web resource: comprehensive TSS database 粕川雄也 (理化学研究所ライフサイエンス技術基盤研究センター機能性ゲノム解析部門) http://fantom.gsc.riken.jp/data/ |
16:20 - 16:45 | Visualization and analysis of CAGE data using ZENBU genome browser system Jessica Michelle Severin (Riken, Center for Life Science Technologies, Division of Genomic Technologies) [関連論文:Interactive visualization and analysis of large-scale sequencing datasets using ZENBU] [Availability:http://sourceforge.net/projects/zenbu/] |
◆ クロージング | |
16:45 - 16:55 | 近藤直人(理化学研究所ライフサイエンス技術基盤研究センター機能性ゲノム解析部門) |
◆懇親会 (17:15- ) |
[言語]
言語は主として日本語です。一部英語のプレゼンテーションがあります。
[参加申し込み]
シンポジウムの参加費は無料です。
シンポジウムと懇親会の参加申し込みは下記フォームよりお願いいたします。
懇親会は自費となりますのでご了承ください。2,000円くらいを想定しています。
[会場へのご案内]
[問い合わせ先]
国立研究開発法人 理化学研究所
ライフサイエンス技術基盤研究センター 機能性ゲノム解析部門
シンポジウム担当
〒230-0045 神奈川県横浜市鶴見区末広町1-7-22
Tel:045-503-9237
E-mail: LSA-support@riken.jp
[個人情報に関する取扱について]
ご記入いただいた個人情報は,参加者の集計および主催者からの連絡に利用させていただきます。